Primeiro, você precisa ir em menu Estoque > Produtos em estoque.
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Na página seguinte, você vai até o produto que deseja informar o peso bruto e líquido e vai clicar na seta ao lado de Visualizar > Alterar, como no exemplo abaixo.
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Você então será redirecionado para a tela de alteração do cadastro do produto. Agora é preciso que vá para a aba "Mais informações":

Na tela de Mais Informações você encontrará os campos a serem preenchidos. É preciso que preencha o campo "Caixas contendo" para que a informação de peso líquido e bruto seja salva e conste na sua NF-e.
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Com esses campos preenchidos, é só salvar as alterações. Pronto! O seu produto está pronto para sair com peso líquido e bruto quando for inserido na sua nota fiscal.